番茄紅素的提取分離方法主要有有機溶劑提取法、酶反應法、微生物發(fā)酵法、人工合成法、超臨界CO2萃取法、微波法等。 其中最傳統(tǒng)的方法是溶劑提取法（即浸提法），但傳統(tǒng)的浸提方法存在著浸提時間長、勞動強度大、原料與處理能耗大、熱敏性組份易破壞等缺點。化學合成的番茄紅素中含多種異構體和雜質，因而禁止在保健品中使用，市場份額銳減；而天然提取法受限于原料，成本難于進一步降低且生產明顯受季節(jié)影響。 因而，開發(fā)微生物發(fā)酵生產法近年來呈現(xiàn)明顯的優(yōu)勢。番茄紅素在自然界中分布十分廣泛?，F(xiàn)階段，人們逐漸意識到合成色素對人體的危害，因此從天然植物中提取番茄紅素成為較普遍的方法。
1. 有機溶劑萃取
原理：番茄紅素是一種具有11個碳碳不飽和雙鍵的脂肪烴，它不溶于水，難溶于甲醇、乙醇，可溶于乙醚、石油醚、己烷、丙酮，易溶于氯仿、二硫化碳、苯等有機溶劑。根據(jù)這一性質，可利用親脂性有機溶劑從番茄中提取番茄紅素。
工藝流程：番茄→搗碎成泥→烘干→粉碎→有機溶劑浸提→提取液→過濾→濾液→濃縮→粗品。提取pH、提取溫度、提取時間是影響提取效果的最主要因素。有機溶劑提取法設備少，工藝簡單，操作方便，但由于番茄中還含有其它成分，而且有機溶劑會有痕量殘留。只單單采用溶劑萃取，得到的產品一般純度不高，番茄紅素含量約在5%-15%左右，而且通常不會產生番茄紅素晶體，而是一種呈油狀的物質，即番茄紅素油樹脂。
2. 超臨界二氧化碳萃取
原理：物質在較高的壓力下，液相和氣相差別縮小，達到某一溫度與壓力時，差別消失合并成一相，此狀態(tài)成為臨界點，此時的溫度和壓力分別稱為臨界溫度和臨界壓力，當溫度和壓力超過臨界點時，其流體的性質介于液體和氣體之間，稱為超臨界流體。超臨界流體具有氣液兩重性的特點，既有與氣體相當?shù)母邼B透能力和低的粘度，又有與液體相近的密度和對物質優(yōu)良的溶解能力。它可從原料中提取出有用成分，從而實現(xiàn)所需要的分離目的，特別適于番茄紅素等熱敏性成分。
工藝流程：新鮮大紅番茄原料→打漿→壓榨過濾→真空干燥→粉碎→過篩→稱重→裝萃取槽、密封→控制適宜的工作參數(shù)→靜態(tài)、動態(tài)萃取→降壓分離→由分離柱獲得番茄紅素→產品質量檢測 。
3. 酶反應法
原理：酶反應法主要是利用番茄皮自身所含有的酶發(fā)生反應來提取番茄紅素。方法是在堿性條件下，使番茄皮中的果膠酶和纖維素酶反應，分解果膠和纖維素，使得番茄紅素的蛋白質復合物從細胞中溶出。工藝流程：清洗新鮮番茄（粗稱）→100℃熱燙去皮（5～7s完成）→打漿→加熱鈍化酶活（85℃，20min）→冷卻到55℃，調pH值4.5左右（用磷酸和氫氧化鈉）→加果膠酶和纖維素酶混合酶（加量0.5g/100g番茄兩種酶比列為1∶2）處理2h→粗濾去核→加入含2%二氯甲烷的石油醚萃取，物料比1∶3左右→分離塔分離→成品 。此方法與傳統(tǒng)的有機溶劑提取法相比，縮短了提取時間，同時提取率也有了顯著的提高。