先了解質粒的基本組成元素。
1)復制起始點Ori。該位點決定了質粒的宿主及質粒的拷貝數(shù),它是質粒中一段特定序列,富含AT和重復序列。
圖譜上只有一個Ori,表示質粒是原核克隆表達質粒;有兩個Ori,則表示該質粒是,穿梭質粒,即可在原核也可在真核中復制。
2)抗性篩選基因。圖譜中Kan/tet就是抗生素抗性基因,方便后續(xù)通過抗生素篩選陽性克隆。特點就是單詞最后會以大寫R或上標r結束。
一般克隆載體只有一種抗性篩選標記,部分表達載體及穿梭質粒具有兩種抗性篩選標記。
3)多克隆位點(MCS),即一系列限制性內切酶酶切位點,是外源DNA插入位點,一般可通過酶切/連接方式將外源DNA插入質粒,外源DNA 一般小于10kb,而片段越長,轉化效率越低。
一般位于轉錄啟動和轉錄終止信號之間;所包含的限制性內切酶位點數(shù)量和組成因載體不同會有所差異,且其中的酶切位點在質粒中為單一的酶切位點;同時在使用時需注意質粒載體與外源DNA酶切位點的兼容性問題。
熒光標記或蛋白標簽序列。蛋白純化標簽蛋白:His-Tag, GST-Tag等;蛋白檢測標簽蛋 白:Myc-Tag, Flag-Tag, HA-Tag 等;熒光蛋白表達標簽:GFP, mCherry 等。