轉(zhuǎn)錄本其實就是基因通過轉(zhuǎn)錄形成的一種或多種可供編碼蛋白質(zhì)的成熟的mRNA。
一個基因有可能有多個轉(zhuǎn)錄本,原因是由于不同的剪接方式造成的。我們都知道,基因轉(zhuǎn)錄之后,首先是形成前體mRNA,通過剪切內(nèi)含子連接外顯子,5'端加帽及3'端加尾之后形成成熟的mRNA。
但是在剪切的過程中可能會剪切掉外顯子,也有可能保留部分內(nèi)含子,這樣就形成了多種 mRNA即多個轉(zhuǎn)錄本。
我們需要特別注意的是大多數(shù)基因有多個轉(zhuǎn)錄本,而且有可能每個轉(zhuǎn)錄本都會編碼產(chǎn)生相應(yīng)的蛋白,這樣就有可能造成一個基因有多種功能。
我們平常研究某個基因時(該基因有多個轉(zhuǎn)錄本),其實我們研究的是它的其中一個轉(zhuǎn)錄本所編碼的蛋白的功能。雖然該基因有多個轉(zhuǎn)錄本,而且每個轉(zhuǎn)錄本都編碼蛋白,但是一般情況下它的不同的轉(zhuǎn)錄本分布在不同類型的細胞中,當然也有可能多種轉(zhuǎn)錄本同時存在于某一 細胞中。
那我們研究該基因時應(yīng)該怎么做呢?
首先,我們需要確定我們應(yīng)該研究該基因的哪個轉(zhuǎn)錄本。
因為我們平常研究某個基因的功能的時候,是因為該基因在某一特定的組織和細胞中表達, 它在這些組織和細胞中具有特定的功能,所以我們只需要確定該基因的哪個轉(zhuǎn)錄本在這些組織和細胞中表達即可。
確定的方法當然就是設(shè)計每種轉(zhuǎn)錄本特異性引物,然后通過RT-PCR就可知道哪種轉(zhuǎn)錄本在 組織和細胞中特異性表達。那這個轉(zhuǎn)錄本就是我們接下來要研究的。
之所以要確定我們應(yīng)該研究哪個轉(zhuǎn)錄本,那是因為它關(guān)系到引物的設(shè)計以及蛋白分子量的計算。
當我們研究某個基因的功能時,通常會抽提總的RNA,然后反轉(zhuǎn)錄得到cDNA,然后將cDNA 連接到表達載體中轉(zhuǎn)化到原核或真核細胞中進行表達,然后進行接下來的研究。
通過反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA時,引物的設(shè)計就是根據(jù)轉(zhuǎn)錄本設(shè)計的。而且之后我們會將表達的蛋 白跑電泳后進行分析,那蛋白的大小是如何計算的呢,當然也是通過該轉(zhuǎn)錄本編碼的蛋白的氨基酸序列計算的。